La segnalazione tempestiva di nuovi patogeni può prevenire o mitigare un’allerta biologica o una pandemia. La nuova generazione di sequenziamento metagenomico (mNGS) di campioni clinici sintomatici permette l’individuazione di elementi epidemici, limitarne la diffusione globale e velocizzare le contromisure. Nell’articolo di Sharma, Pannu, Ecker, et al. pubblicato su Health Security, viene proposta l’architettura del metagenomic Next Generation Sequencing, NGS, definita “threat net” che pone l’accento sul pronto soccorso quale prioritario luogo di sorveglianza. Viene sviluppato un modello di simulazione “susceptible-exposed infected-removed” SEIR, per stimare l’efficacia del Threat Net nell’individuare la diffusione di nuovi patogeni respiratori. L’analisi serve a quantificare il valore della routine clinica del mNGS per localizzare pandemie respiratorie con stima del costo e efficacia epidemiologica a diversi livelli della copertura ospedaliera negli Stati Uniti.  Threat Net dovrebbe costare tra 400 mln e 800 mln/anno e avere il 95% di probabilità di individuare un nuovo patogeno respiratorio con caratteristiche come SARS-CoV-2: implementare Threat Net significa prevenire la diffusione di patogeni respiratori pandemici. Health Security – 26 settembre 2023